Nowa technika sekwencjonowania DNA znacząco przyspiesza i poprawia dokładność diagnozowania infekcji bakteryjnych, co może zmniejszyć liczbę zakażeń szpitalnych i skuteczniej wykrywać bakterie oporne na antybiotyki. Metoda opracowana przez Agencję Regulacyjną ds. Leków i Produktów Opieki Zdrowotnej (MHRA) we współpracy z brytyjskim National Health Service (NHS) została już z powodzeniem przetestowana w siedmiu londyńskich szpitalach.
Nowoczesna metoda kontra tradycyjna diagnostyka
Dotychczasowe metody wykrywania infekcji bakteryjnych wymagają nawet 7 dni, a w przypadku gruźlicy diagnoza może trwać aż 8 tygodni. Długotrwałe oczekiwanie na wyniki może opóźniać leczenie i utrudniać kontrolę zakażeń.
Nowa technika wykorzystuje sekwencjonowanie nanoporowe oraz analizę amplikonu genu rybosomalnego RNA 16S (16S rRNA), co pozwala na szybkie i precyzyjne identyfikowanie patogenów. Jak podkreślają eksperci, ma to kluczowe znaczenie w diagnozowaniu zakażeń układu nerwowego (zapalenie opon mózgowych), układu oddechowego (zapalenie płuc), infekcji kostno-stawowych oraz sepsy.
Dlaczego test DNA to rewolucja?
Obecnie tylko nieliczne laboratoria NHS przeprowadzają testy oparte na sekwencjonowaniu genów 16S rRNA, a ich procedury nie są w pełni ustandaryzowane. Brak jednolitych materiałów referencyjnych sprawia, że wiele placówek zmuszonych jest do wysyłania próbek do laboratoriów zewnętrznych, co generuje dodatkowe koszty i wydłuża czas oczekiwania na wyniki.
Aby rozwiązać ten problem, zespół naukowców z Barts Health NHS Trust, National Measurement Laboratory, University of Surrey i MHRA opracował kompleksowe wytyczne dotyczące sekwencjonowania nanoporowego. Jak wynika z badań opublikowanych w czasopiśmie Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, metoda ta zapewnia spójność i wysoką czułość wyników, co zwiększa jej wartość diagnostyczną.
Test DNA w praktyce – szybka identyfikacja patogenów
Od 2024 roku nowa metoda jest stosowana do analizy ponad 2000 próbek pacjentów w londyńskich szpitalach. Technika pozwala nie tylko dokładnie określić, która bakteria wywołała infekcję, ale również wskazać, na które antybiotyki jest wrażliwa.
To przełomowe zastosowanie technologii w szpitalach skróci czas diagnozy z tygodni do zaledwie dwóch dni – podkreśla minister zdrowia Wielkiej Brytanii Ashley Dalton.
Metoda ta jest również testowana w celu zapobiegania epidemiom szpitalnym spowodowanym przez superbakterie oporne na antybiotyki. Przykładem jest badanie epidemii lekoopornej Escherichia coli, która w listopadzie 2024 roku dotknęła 58 pacjentów w szpitalu Newham.
Jak wyjaśnia dr Ian Butler, główny naukowiec kliniczny w dziedzinie mikrobiologii medycznej w Barts Health:
Analizując bezpośrednio bakteryjny materiał genetyczny, możemy wykrywać dokładniej i szybciej niż tradycyjne metody, nawet bardzo złożone infekcje. Oznacza to, że możemy precyzyjnie zdiagnozować infekcję i szybciej określić właściwe leczenie – zwłaszcza w przypadku pacjentów w stanie krytycznym.
Standaryzacja i przyszłość technologii
MHRA pracuje nad ujednoliceniem i wdrożeniem testu DNA w skali całego NHS. Dr Chrysi Sergaki, szefowa działu mikrobiomu w MHRA, podkreśla:
Opracujemy i dostarczymy materiały referencyjne, które mają zapewnić, że szpitale osiągną spójne, wiarygodne i dokładne wyniki.
Celem jest uczynienie sekwencjonowania DNA rutynową częścią diagnostyki szpitalnej w całym kraju. Nowa technologia może pomóc w walce z opornością na antybiotyki i znacząco zwiększyć skuteczność leczenia pacjentów.
Źródło:
- termedia.pl
- frontiersin.org
