Naukowcy z University of Hawaiʻi zidentyfikowali zestaw 31 małych niekodujących RNA (sncRNA) obecnych w egzosomach osocza, który był związany z późniejszym rozwojem raka płuca. Co istotne, sygnał można było wykryć nawet 10 lat przed kliniczną diagnozą. Wyniki opublikowano w czasopiśmie „Advanced Science”.
Z tego artykułu dowiesz się…
- Jakie markery RNA we krwi mogą być związane z ryzykiem raka płuca nawet 10 lat przed diagnozą.
- Jaki jest panel 31 małych niekodujących RNA (sncRNA) zidentyfikowany przez naukowców z University of Hawaiʻi.
- Jaką skuteczność osiągnął model wykorzystujący markery RNA do oceny ryzyka raka płuca i jakie czynniki uwzględniono w analizie.
- Dlaczego odkrycie może mieć znaczenie dla przyszłej stratyfikacji ryzyka raka płuca oraz dlaczego nie jest to jeszcze test przeznaczony do rutynowej diagnostyki.
31 markerów RNA związanych z ryzykiem raka płuca
Badacze przeanalizowali próbki krwi pobrane przed rozpoznaniem choroby. Badanie objęło prospektywną kohortę 202 palaczy, w tym 68 osób, u których podczas trwającej nawet 16 lat obserwacji rozwinął się rak płuca. Naukowcy wyodrębnili panel 31 małych niekodujących RNA. Obejmował on 15 mikroRNA, osiem piRNA, siedem fragmentów pochodzących z tRNA oraz jedną cząsteczkę należącą do tzw. tRNA halves.
Głównym pytaniem w tym badaniu było to, czy sygnał molekularny (mierzalna zmiana biologiczna) przyszłego raka płuc może być obecny we krwi już na wiele lat przed diagnozą – powiedział Feng.
Model osiągnął AUC 0,97
Na podstawie zidentyfikowanych markerów naukowcy opracowali model wykorzystujący uczenie maszynowe. W testach w ramach zagnieżdżonej walidacji krzyżowej model random forest osiągnął AUC na poziomie 0,97, przy czułości 0,93 i swoistości 1,00. Wynik ryzyka oparty na sncRNA pozostawał istotnie związany z późniejszym wystąpieniem raka płuca również po uwzględnieniu wieku, płci, pochodzenia etnicznego oraz czynników związanych z paleniem. Co szczególnie interesujące, związek obserwowano nawet do 10 lat przed rozpoznaniem nowotworu.
Czy badanie krwi pomoże wcześniej określić ryzyko raka płuca?
Autorzy wskazują, że krążące egzosomalne sncRNA mogą w przyszłości wspierać długoterminową ocenę ryzyka raka płuca. Nie oznacza to jednak, że opracowano już gotowy test przesiewowy. Wyniki wymagają dalszej walidacji w niezależnych kohortach z próbkami pobranymi przed diagnozą. Ma to szczególne znaczenie w kontekście poszukiwania biomarkerów pozwalających dokładniej identyfikować osoby wymagające intensywniejszego nadzoru. Zespół University of Hawaiʻi ubiega się obecnie o ochronę patentową panelu biomarkerów i jego potencjalnego zastosowania klinicznego.
Markery RNA a przyszłość wczesnego wykrywania raka płuca
Badanie dostarcza kolejnych dowodów na to, że zmiany molekularne związane z przyszłym rozwojem nowotworu mogą być obecne we krwi na długo przed jego klinicznym rozpoznaniem. Panel 31 sncRNA może stać się podstawą dalszych badań nad nowymi metodami stratyfikacji ryzyka raka płuca. Na obecnym etapie jest jednak narzędziem badawczym, a nie testem przeznaczonym do rutynowej diagnostyki.
Główne wnioski
- Naukowcy z University of Hawaiʻi zidentyfikowali panel 31 małych niekodujących RNA (sncRNA) związanych z późniejszym ryzykiem raka płuca.
- Sygnał molekularny pozostawał związany z przyszłym rozwojem raka płuca nawet 5–10 lat przed kliniczną diagnozą, również po uwzględnieniu m.in. wieku, płci, pochodzenia etnicznego i czynników związanych z paleniem.
- Model oparty na markerach RNA osiągnął AUC 0,97, czułość 0,93 i swoistość 1,00 w zastosowanej przez badaczy walidacji.
- Panel sncRNA może w przyszłości wspierać długoterminową ocenę i stratyfikację ryzyka raka płuca, jednak przed zastosowaniem klinicznym wymaga dalszej walidacji w niezależnych kohortach.
Źródło:
- https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.76729
