Nowe oprogramowanie Genome-Wide (GW) przetwarza dane genomiczne nawet 100 razy szybciej niż dotychczasowe rozwiązania. Narzędzie porównywane do „Google Earth” dla genomiki może zmienić sposób analizy strukturalnych zmian w DNA komórek nowotworowych. Dla badaczy onkologicznych oznacza to nie tylko oszczędność czasu, ale także możliwość dynamicznego śledzenia złożonych zmian genetycznych, które dotąd były trudne do uchwycenia.
Z tego artykułu dowiesz się…
- Jakie możliwości oferuje nowe oprogramowanie Genome-Wide w analizie danych genetycznych.
- Dlaczego szybkość przetwarzania danych ma tak ważne znaczenie w badaniach nad rakiem.
- Jakie są ograniczenia dotychczasowych narzędzi do wizualizacji zmian genomowych.
- W jaki sposób GW może wspierać rozwój diagnostyki i terapii celowanych w onkologii.
Genome-Wide – nowe podejście do eksploracji genomu
Narzędzie Genome-Wide zaprezentowane przez dr Kez Cleal z School of Medicine stanowi ważny krok naprzód w analizie dużych zbiorów danych genetycznych. Jego wyjątkowość polega na zdolności dynamicznej wizualizacji zmian w genomie — w czasie rzeczywistym i w znacznie większej skali niż dotąd.
Obecne przeglądarki genomiczne są użyteczne, ale mają poważne ograniczenia wydajnościowe. Przede wszystkim nie radzą sobie z analizą dużych i złożonych rearanżacji genetycznych. Nowe oprogramowanie eliminuje te bariery, umożliwiając szybszą i bardziej precyzyjną pracę z danymi.
Szybsze analizy, szybsze odkrycia
GW przyspiesza przetwarzanie danych aż 100 razy w porównaniu z aktualnymi narzędziami, co może istotnie skrócić czas potrzebny na analizę dużych zestawów danych. Ma to ogromne znaczenie w kontekście badań nad rakiem, gdzie każda godzina pracy może pomóc w szybszym odkryciu istotnych zmian genetycznych i potencjalnych celów terapeutycznych. Oprogramowanie otwiera także nowe możliwości w analizie strukturalnych zmian genomowych – często trudnych do wychwycenia przy użyciu klasycznych narzędzi.
Potencjał diagnostyczny i terapeutyczny
Zespół pracujący nad GW nie zamierza poprzestać na usprawnieniu samego procesu badawczego. Kolejnym etapem ma być opracowanie narzędzi diagnostycznych, które pomogą identyfikować pacjentów z nietypowymi zmianami w strukturze genomu i klasyfikować ich pod kątem ryzyka onkologicznego.
W dalszej perspektywie celem jest również lepsze zrozumienie mechanizmów biologicznych napędzających zmiany genetyczne i opracowanie sposobów ich terapeutycznego hamowania.
Główne wnioski
- Oprogramowanie Genome-Wide przetwarza dane genomiczne 100 razy szybciej niż dotychczasowe narzędzia, znacząco skracając czas analiz.
- Nowa technologia pozwala na dynamiczną wizualizację dużych obszarów genomu, jest to ważne przy identyfikacji złożonych zmian genetycznych w nowotworach.
- Zespół badawczy pracuje nad zastosowaniem GW w diagnostyce i klasyfikacji pacjentów z nieprawidłowymi strukturami genetycznymi.
- Genome-Wide otwiera nowe możliwości dla onkologii precyzyjnej i terapii ukierunkowanych na konkretne zmiany genomowe.
Źródło:
- Cardiff University
